从东京都西部被分割出来的这座城市，超能力开发被列为学校课程的一部分。在二百三十万人口中，其中占八成的学生每天都在头脑开发上互相竞争，故事的主角，上条当麻，是学院里唯一的一个零能力者，但是并非是完全没有能力，他的能力是，取消一切能力效果的无效化能力，能使用这种能力的，也只局限于他的右手，他给自己的这种连上帝的奇迹都能抹杀的能力取名为幻想杀手，某日，在家里的阳台上，他与神秘的少女相遇了…… 详细剧情